Koszalińska delegatura będzie podlegać oddziałowi IPN w Gdańsku i będzie się składać z dwóch pionów: prokuratorskiego - Komisji Ścigania Zbrodni przeciwko Narodowi Polskiemu (prokurator Andrzej Bukowski z Koszalina już współpracuje) oraz archiwalnego Wydziału Udostępniania i Archiwizacji Dokumentów.